Το θυμαρίσιο μέλι του νησιού είναι μυρωδάτο, διαυγές και χρυσόξανθο χρώμα. Οι μέλισσες βόσκουν σε μυρωδάτα και πλούσια βότανα, όπως θυμάρι, θρούμπι, ρίγανη αλλά και σε λυγαριές, για να παράξουν το μυρωδάτο μέλι της Κύθνου, που αποτελεί εμπορεύσιμο προϊόν. Στο παρελθόν οι κυψέλες (τα ψέλια) ήταν πήλινες σε σχήμα κόλορου κώνου, τοποθετημένες σε πέτρινες θυρίδες σε τοίχους στα χωράφια. Το στόμιο έκλεινε με πέτρα ή πήλινο καπάκι, με τέτοιο τρόπο που άφηνε ανοίγματα για να μπαίνουν και να βγαίνουν οι μέλισσες.

Η συγκομιδή του μελιού ή τρύγος γίνεται πάντα το καλοκαίρι, κυρίως τον Αύγουστο μετά την γιορτή της Μεταμόρφωσης του Σωτήρος στις 6 Αυγούστου.